Adapter-Ligation

Wie im Abschnitt Endreparatur erläutert, besteht der Zweck des Hinzufügens von Adenin am Ende des DNA-Strangs darin, eine spezifische Paarung mit dem Thymin-Schwanz des Adapters zu ermöglichen.

Der Adapter ist ein kurzes komplementäres Stück doppelsträngiger DNA. Ein Strang hat einen T-Schwanz am 3'-Ende und der andere Strang ist komplementär zum ersten Strang.

Da sich Adenin spezifisch mit Thymin paart, können wir sicher sein, dass ein Ende der DNA-Probe den blauen Adapter aufweist, während das andere Ende den orangen Adapter aufweist.

Funktionen von Adaptern

Die Adapter haben wichtige Funktionen beim Next Generation Sequencing.

Primers

Die Adapter dienen auch als universelle Primer-Andockstellen. Es ist nicht möglich, Primer individuell passend zu einem bestimmten DNA-Molekül zu konstruieren, um unser gesamtes Genom zu amplifizieren! Die Adapter sorgen für eine Kappe für all die verschiedenen DNA-Stränge, so dass wir nur zwei Primer-Sets verwenden müssen, um die verschiedenen kleinen DNA-Moleküle zu amplifizieren.

Durchflusszellen-Docker

Die Adapter helfen den DNA-Molekülen auch, an die Durchflusszelle anzudocken / sich anzuhaften. Die Durchflusszelle ist mit vielen kurzen DNA-Molekülen bedeckt, die zum Adapter komplementär sind. Wenn DNA-Moleküle in die Durchflusszelle gepumpt werden, erkennen die Adapter die kurzen DNA-Moleküle, die an der Durchflusszelle anhaften, und verbinden sich. Dies ist wichtig, damit die Clusterbildung stattfinden kann.