BLAST-Analyse

BLAST verwendet Statistiken, um die Sequenzdatenbank zu sortieren und so die besten Übereinstimmungen zu ermitteln.

Abbildung 1: Farbcodierter Alignment Score

Der Benutzer erhält die folgende Ausgabe:

• Maximale Punktzahl

• Gesamtpunktzahl

• Abfrageabdeckung

• E-Wert

• Maximale Identität

Der E-Wert bzw. erwartete Wert gibt die Anzahl der Treffer an, die man in einer Datenbank derselben Größe zu finden erwartet. Niedrige E-Werte weisen auf ein signifikantes Ergebnis hin. Die maximale Identität stellt den Prozentsatz der gemeinsamen Identitäten zwischen der Abfrage und dem Treffer in einem Nukleotid-zu-Nukleotid-Alignment dar. Die Alignment Scores sind numerische Werte, die die Gesamtqualität eines Alignments beschreiben. Der Prozentsatz der Abfragelänge, der in den ausgerichteten Segmenten enthalten ist, wird als Abfrageabdeckung bezeichnet.

Abbildung 2: BLAST-Ergebnis