CY3 und CY5

Die Fluoreszenzfarbstoffe Cy3 und Cy5 binden an die DNA. Sie sind lichtempfindlich und sollten möglichst im Dunkeln gelagert und verwendet werden. Daher werden die Markierungsschritte in dunklen Röhrchen durchgeführt, um Signalverluste durch das Ausbleichen der Farbstoffe zu vermeiden.

Die Cy3- und Cy5-Moleküle interagieren mit der DNA über ein Universal Linkage System (ULS), das eine spezielle Platinverbindung verwendet. Die Platinverbindung hat zwei freie Bindungsstellen. Die erste Bindungsstelle bindet an eine Markergruppe, nämlich die Cyaninverbindung (Cy3 und Cy5), und bildet einen Cy-ULS-Komplex. Die zweite Bindungsstelle bindet den Komplex an das Purin einer einzelsträngigen, doppelsträngigen, linearen oder supergewickelten DNA oder RNA.

Links: Cy3-Markierung Rechts: Cy5-Markierung

Die Cy3- und Cy5-Moleküle interagieren mit der DNA über das Universal Linkage System (ULS), das eine spezielle Platinverbindung verwendet. Die Platinverbindung hat zwei freie Bindungsstellen. Die erste Bindungsstelle bindet an eine Markergruppe, nämlich die Cyaninverbindung (Cy3 und Cy5), und bildet einen Cy-ULS-Komplex. Die zweite Bindungsstelle bindet den Komplex an das Purin einzelsträngiger, doppelsträngiger, linearer oder supergewundener DNA, RNA oder Chromosome.