DNA-Leiter

Eine „Leiter“ aus Nukleinsäuren, auch Komigrationsstandard genannt, ist eine Kombination von DNA- oder RNA-Fragmenten mit bekannten Längen. Sie wird verwendet, um die Längen unbekannter Nukleinsäurefragmente bei der Durchführung einer Gel-Elektrophorese zu bestimmen. Die Größe der Fragmente wird bestimmt, indem eine Gel-Elektrophorese mit der Leiter in einer Geltasche neben der unbekannten Probe durchgeführt wird. Die Banden der DNA-Leiter haben eine bestimmte Länge, wie „100 bp“, „500 bp“ usf. Wenn eine Bande einer unbekannten Probe gleich weit durch das Gel gewandert ist, wie die 500 bp Bande, kann man annehmen, dass das unbekannte Fragment eine Länge von genau oder fast 500 bp hat.

Ein Beispiel einer DNA-Leiter unter Verwendung einer 10-Mikroliter-Probe auf einem zweiprozentigen Agarosegel. Die Leiter erscheint als 8 helle Banden vor einem schwarzen Hintergrund. Das größte und schwerste Fragment besteht aus 2000 Basenpaaren und erscheint an der Spitze der Leiter, das kleinste Fragment besteht aus 50 Basenpaaren. Die Anzahl der Basenpaare in einem Fragment nimmt ab, wenn sich die Banden zur Anode hin bewegen.

Eine Gel-Elektrophorese wird normalerweise mit einer „Leiter“ in einer der Geltaschen durchgeführt. Fragmentlängen werden in Basenpaaren (bp) angegeben. In diesem Bild wird außerdem die Konzentration des Fragments der „Leiter“ in ng/10 uL angegeben.