Endreparatur

Fragmentierte DNA (entweder künstlich fragmentiert oder teilweise degradiert) hat typischerweise klebrige Enden, was bedeutet, dass ein Strang länger ist als der andere (siehe Abbildung 1).

Abbildung 1. DNA mit stumpfen Enden, bei der beide Stränge gleich lang sind, im Vergleich zu DNA mit klebrigen Enden, bei der ein Strang länger ist als der andere.

DNA mit klebrigen Enden ligiert leicht an andere DNA mit komplementären klebrigen Enden. Um zu vermeiden, dass sich DNA mit diesen klebrigen Enden mit einer anderen DNA verbindet, müssen wir sie in DNA mit stumpfen Enden umwandeln (siehe Abbildung 1). Einer der Schritte in der NGS-Probenvorbereitung besteht darin, diese klebrigen Enden zu reparieren und DNA mit stumpfen Enden zu erzeugen. Dies ist wichtig für den nächsten Schritt, den A-Überhang.

Siehe auch: Endreparatur-Enzyme