Endreparatur-Enzyme

Für die Reparatur von DNA mit klebrigen Enden werden in der Regel zwei Enzyme verwendet (siehe Abbildung 1)

  • Polymerase: Die Polymerase füllt die fehlenden Basen für den Strang in der Richtung 5' zu 3' auf. Die entstehende doppelsträngige DNA hat die gleiche Länge wie der ursprünglich längste DNA-Strang.
  • Exonuklease: Die Exonuklease entfernt die 3'-Überhänge. Die resultierende doppelsträngige DNA hat die gleiche Länge wie der ursprünglich kürzeste DNA-Strang.

Zwei Reaktionen, die zeigen, wie Polymerase und Exonuklease klebrige DNA-Enden reparieren. Die erste Reaktion beginnt mit dem Nukleotid G, das von der 5. bis zur 3. Primzahl reicht, und den Nukleotiden C, T, T, A, A, die von der 3. bis zur 5. Primzahl reichen. Über dem Reaktionspfeil steht d N T P s, und darunter ist die Aktivität der Polymerase von 5 Primzahlen zu 3 Primzahlen zu sehen. Am Ende der Reaktion wird das klebrige Ende aufgefüllt, sodass ein Fragment mit stumpfem Ende entsteht. Die 5 prime to 3 prime enthält die Nukleotide G, A, A, T, T, und die 3 prime to 5 prime die Nukleotide C, T, T, A, A. Die zweite Reaktion beginnt mit der 5 prime to 3 prime, die die Nukleotide G, G, T, A, C enthält, und einer 3 prime to 5 prime, die das Nukleotid C enthält. Das bedeutet, dass es einen 3 prime Überhang gibt und ein klebriges Ende nach der K p n 1 Spaltung gebildet wurde. Über dem Reaktionspfeil steht d N T P s und darunter die 3 prime to 5 prime Exonuklease-Aktivität der Polymerase. Am Ende der Reaktion wird das klebrige Ende entfernt, um ein Fragment mit stumpfem Ende zu erhalten. Das 5 prime to 3 prime enthält das Nukleotid G und das 3 prime to 5 prime enthält das Nukleotid C.

Abbildung 1. Die Polymerase fügt Nukleotide in der Richtung 5' → 3' hinzu und die Exonuklease entfernt Nukleotide aus den 3'-Überhängen.

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