Vorbereitung der Gelelektrophorese
Um ein Gelelektrophorese Experiment durchzuführen, brauchst du Folgendes:
- Halbfeste, poröse Gelmatrix
- DNA- oder RNA-Probe
- Ladepuffer
- Farbstoff
- Molekulargewichts-Standardproben oder „Leitern“
Halbfeste, poröse Gelmatrix: Dies ist normalerweise ein Agarose- oder Polyacrylamid-Gel. Im virtuellen Labor wird dieses Gel bereits in der Gelelektrophorese-Maschine vorbereitet.
DNA oder RNA Probe: Isolierte, behandelte DNA oder RNA, in einer ausreichenden Menge, um in einem Gelelektrophorese-Experiment sichtbar zu werden.
Ladepuffer: Der Ladepuffer enthält ein Farbreagenz, das dabei hilft, sichtbar zu machen, wie weit die DNA oder RNA während der Gelelektrophorese gereist ist. Der Ladepuffer macht die Probe auch schwerer, so dass sie auf den Boden des Gels sinkt.
Dieser enthält typischerweise die folgenden Chemikalien:
- Färbendes Reagenz, z. B. Xylencyanol, Kresolrot, Bromphenolblau oder Orange G
- Hochviskoses Reagenz, z. B. Ficoll, Saccharose oder Glycerin, um die Probe zähflüssiger und schwerer zu machen
- Wasser, um die oben erwähnten Reagenzien zu verdünnen
Farbstoff: Fluoreszierende oder farbige Farbstoffe, die an Nukleinsäuren binden, werden der Gelmischung während der Vorbereitung hinzugefügt. Alternativ kann das Gel nach Abschluss der Elektrophorese in die Farbstofflösung getränkt werden.
Molekulargewichts-Standardproben: Diese werden neben der DNA- oder RNA-Probe gelaufen, um eine Größenreferenz zu liefern. Sie sind auch als „Leitern“ bekannt.