Mikrosatelliten

Microsatelliten sind kurze repetitive DNA-Sequenzen aus zwei bis sechs Basenpaaren. Die Anzahl der Repetitionen variiert zwischen Individuen; sie repräsentieren die unterschiedlichen Allele. Beispielsweise hat Allel 1 vier Repetitionen, Allel 2 fünf Repetitionen, Allel 3 hat sechs Repetitionen, usw. SNPs können ebenfalls als Marker in der Kopplungsanalyse verwendet werden; es gibt jedoch nur zwei Allele für SNPs. Zum Beispiel C/T, was bedeutet, dass Allel 1 C besitzt, während Allel 2 T besitzt. Aufgrund der größeren Variabilität der Mikrosatelliten im Vergleich zu den SNPs, ist es einfacher, Mikrosatelliten für die Kopplungsanalyse zu verwenden.

Einer der häufigsten Mikrosatelliten ist (CA)_n, wobei _n die Anzahl der CA-Repetitionen darstellt. Die Anzahl kann zwischen drei und 100 variieren und führt somit zu einer großen Anzahl an unterschiedlichen Allelen in der Population. Denke daran, dass diese große Anzahl an unterschiedlichen Allelen in der Population und nicht in einem Individuum vorkommt! Wir besitzen nur zwei Kopien der Chromosomen, was bedeutet, dass wir maximal zwei unterschiedliche Allele besitzen können. Wenn ein Individuum zwei unterschiedliche Allele hat, zum Beispiel (CA)₁₀ und (CA)₁₅, dann sagt man, dass diese Person heterozygot für den Mikrosatelliten ist. Im Gegensatz dazu ist ein Individuum, das nur ein Allel besitzt, homozygot für den Mikrosatelliten. Wir können die Genotypen der Mikrosatelliten bestimmen, indem wir ihn mit Hilfe von PCR amplifizieren und die Länge (die Anzahl der Repetitionen) mit Hilfe von Gelelektrophorese analysieren.