Molekulare Identifikation

Die klassischen Methoden der Mikrobenidentifizierung sind sehr mühsam und beinhalten eine Bakterienkultur im Labor. Die Identifizierung mit molekularen Methoden hat die Geschwindigkeit und Genauigkeit stark verbessert. Bei diesen Methoden werden Nukleinsäuresequenzen (DNA und RNA) von unbekannten und bekannten Spezies (aus einer Datenbank) miteinander vergleichen, um die Ähnlichkeit der Sequenzen zu bestimmen. Es werden hauptsächlich zwei Methoden zur molekularen Identifizierung verwendet:

Genotypische Methoden

Diese Methoden beinhalten die Extraktion von genomischer DNA einer unbekannten Mikrobenart, die dann mit Hilfe von Southern Blot, Polymerase-Kettenreaktion (PCR) oder Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus (RFLP) ausgewertet werden.

Protein-basierte Methoden

Diese Methoden beinhalten Western Blot, Immuno-Präzipitation und Enzyme-linked Immunoabsorbant Assay (ELISA), bei denen Antikörper zur Detektion von spezifischen Proteinen verwendet werden.