Restriktionsbedingung

Die meisten Restriktionsenzyme haben ein Temperaturoptimum von 37 °C und ein pH-Optimum von 7,2 oder 8,5. Diese Anforderungen an die physikalische Umgebung müssen erfüllt sein, um sicherzustellen, dass das Enzym seine maximale Aktivität erreicht. Inkubationstemperaturen beeinflussen die Aktivität von Restriktionsenzymen stark. Das Enzym kann außerhalb des angestrebten Bereichs von physikalischen Bedingungen denaturieren. Enzyme arbeiten sehr spezifisch; daher können sie nicht richtig arbeiten, wenn ihre Struktur sich verschlechtert. Da jedes Restriktionsenzym aus verschiedenen Bakterien isoliert wird und unterschiedliche optimale Reaktionsbedingungen hat, benötigt es für jede Restriktionsreaktion spezifische Puffer.

Tabelle 1: Aktivitäten der Enzyme. Die Zahl für jeden Puffer gibt die Aktivität des jeweiligen Enzyms an. Steht ein *, können die Enzyme in diesem Puffer eine Sternaktivität aufweisen.

Enzyme Sequenz Puffer 1 Puffer 2 Puffer 3 Inku. Temp.
EcoRI G'AATTC 25 100* 50 37 °C
KpnI GGTAC'C 100 75 10 37 °C
PstI CTGCA'G 75 75 100 37 °C
SpeI A'CTAGT 75 100 25 37 °C
XbaI T'CTAGA 10 100 75 37 °C
XhoI C'TCGAG 75 100 100 37 °C