Restriktionsbedingung
Die meisten Restriktionsenzyme haben ein Temperaturoptimum von 37 °C und ein pH-Optimum von 7,2 oder 8,5. Diese Anforderungen an die physikalische Umgebung müssen erfüllt sein, um sicherzustellen, dass das Enzym seine maximale Aktivität erreicht. Inkubationstemperaturen beeinflussen die Aktivität von Restriktionsenzymen stark. Das Enzym kann außerhalb des angestrebten Bereichs von physikalischen Bedingungen denaturieren. Enzyme arbeiten sehr spezifisch; daher können sie nicht richtig arbeiten, wenn ihre Struktur sich verschlechtert. Da jedes Restriktionsenzym aus verschiedenen Bakterien isoliert wird und unterschiedliche optimale Reaktionsbedingungen hat, benötigt es für jede Restriktionsreaktion spezifische Puffer.
Tabelle 1: Aktivitäten der Enzyme. Die Zahl für jeden Puffer gibt die Aktivität des jeweiligen Enzyms an. Steht ein *, können die Enzyme in diesem Puffer eine Sternaktivität aufweisen.
Enzyme | Sequenz | Puffer 1 | Puffer 2 | Puffer 3 | Inku. Temp. |
---|---|---|---|---|---|
EcoRI | G'AATTC | 25 | 100* | 50 | 37 °C |
KpnI | GGTAC'C | 100 | 75 | 10 | 37 °C |
PstI | CTGCA'G | 75 | 75 | 100 | 37 °C |
SpeI | A'CTAGT | 75 | 100 | 25 | 37 °C |
XbaI | T'CTAGA | 10 | 100 | 75 | 37 °C |
XhoI | C'TCGAG | 75 | 100 | 100 | 37 °C |