Kurze Tandem-Wiederholungsanalyse (STR-Analyse)

Eine der gängigsten Methoden zur Erstellung eines DNA-Profils ist die Durchführung einer kurzen Tandem-Wiederholungsanalyse (STR-Analyse). Das Verfahren ist wie folgt:

  • 1) Extrahiere und reinige die DNA einer Probe.
  • 2) Verwende die PCR-Technik, um die kurzen Tandem-Wiederholungen (STRs) zu amplifizieren. Ein Set von Primern, die an den flankierenden Regionen einer variablen Sequenz platziert werden, amplifizieren Fragmente unterschiedlicher Länge in Abhängigkeit von der Anzahl der Wiederholungen (siehe Abbildung unten). Es besteht die Möglichkeit, dass zwei Individuen die gleiche Anzahl von Wiederholungen an einer bestimmten Wiederholungsstelle aufweisen. Würden wir nur ein Primer-Set verwenden (nur eine Wiederholungsregion amplifizieren), wäre das Risiko, dass ein Individuum dieselbe Anzahl von Wiederholungen mit einem anderen Individuum teilt, zu groß. Daher werden bei der Erstellung von DNA-Profilen mindestens 13 Tandem-Wiederholungsstellen untersucht.

  • 3) Verwende die Gelelektrophorese, um die Länge der Tandemwiederholungen zu analysieren und das DNA-Profil zu erhalten.

Potenzielle kurze Tandemwiederholungseinheiten und Fragmentlängen der Zielregion. Dargestellt sind DNA-Stränge mit unterschiedlicher Anzahl von Wiederholungseinheiten. In jedem Strang befindet sich ein Primer am Anfang und am Ende der Tandem-Wiederholungseinheiten, so dass das amplifizierte Fragment je nach Anzahl der Wiederholungen der Einheit unterschiedlich groß ist. Im Beispiel sind 5 verschiedene Fragmentlängen dargestellt, die einer unterschiedlichen Anzahl von Tandem-Wiederholungseinheiten entsprechen, von 7 bis 11 Einheiten. Die Wiederholungseinheiten können aus einer unterschiedlichen Anzahl von Nukleotiden bestehen. Eine 2-Nukleotid-Wiederholungseinheit könnte zum Beispiel aus aufeinanderfolgenden C.A. bestehen. Die Anzahl der Wiederholungseinheiten bestimmt die Fragmentgröße, die von Person zu Person variieren kann. Wiederholungseinheiten können auch aus 3, 4 oder sogar 5 Nukleotiden bestehen