STR-Marker

STR-Marker (Short Tandem Repeat) sind polymorphe Sequenzen, die in gleichmäßigen Abständen in Säugetiergenomen vorkommen.

Die Kernwiederholungen können Di- (zwei Basen, z. B. CA), Tri- (drei Basen, z. B. CAG) oder Tetra-Nukleotide (vier Basen, z. B. ATGC) sein. Diese Kernsequenzen werden einige Male hintereinander wiederholt (z. B. CACACACACACA oder CA in Klammern mal 6).

Verschiedene Allele haben eine unterschiedliche Anzahl von Wiederholungen in den einzelnen STR-Loci. In der Population können mehrere Allele vorhanden sein (z. B. fünf verschiedene Allele), aber in einem Individuum (Diploid) gibt es höchstens zwei verschiedene Allele (eines auf jedem homologen Chromosom).

Die STR-Loci werden von eindeutigen Sequenzen flankiert, sodass die einzelnen STR-Loci durch PCR amplifiziert und die Größe der Allele durch Gelelektrophorese geschätzt werden kann. Auf diese Weise kann eine Genotypisierung der einzelnen Marker durchgeführt werden.