Ligación del adaptador

Como se explica en la sección del voladizo A, el propósito de añadir adenina al final de la cadena de ADN es permitir el emparejamiento específico con la cola de timina del adaptador.

El adaptador es una pequeña parte complementaria del ADN bicatenario (ver la figura a continuación). Una hebra tiene una cola T en el extremo 3', que se complementa con el voladizo A del ADN y garantiza que una de las dos cadenas del adaptador (aquí en azul y naranja) estará presente en el extremo de cada cadena de la muestra de ADN.

Funciones de los adaptadores

Los adaptadores tienen funciones importantes en la secuenciación de nueva generación:

Cebadores: Los adaptadores también sirven como puntos universales de acoplamiento de cebadores para la amplificación de PCR. Como desconocemos la secuencia de nuestra muestra de ADN (¡de ahí que necesitemos secuenciar!), no podemos diseñar cebadores específicos para la PCR. Los adaptadores proporcionan un molde para todas las diferentes cadenas de ADN, de modo que solo tenemos que utilizar dos conjuntos de cebadores para amplificar todas las moléculas pequeñas de ADN diferentes de la muestra.

Acopladores de la célula de flujo: Los adaptadores también ayudan a estas moléculas de ADN a acoplarse/adherirse a la célula de flujo en la máquina de secuenciación. La célula de flujo está cubierta de muchas moléculas cortas de ADN que son complementarias al adaptador. Cuando las moléculas de ADN se bombean a la célula de flujo, los adaptadores se unen específicamente a estas moléculas cortas de ADN. Esto es imprescindible para que se produzca la generación de clústeres.