Ligación del adaptador

Como se explica en la sección reparación de extremos, el propósito de añadir adenina al final de la cadena de ADN es permitir el emparejamiento específico con la cola de timina del adaptador.

El adaptador es una pequeña parte complementaria del ADN bicatenario. Una hebra tiene una cola T en el extremo 3', y la otra hebra es complementaria a la primera cadena.

Como la adenina se empareja específicamente con la timina, un extremo de la muestra de ADN tendrá el adaptador azul, mientras que el otro extremo tendrá el adaptador naranja.

Funciones de los adaptadores

Los adaptadores tienen funciones importantes en la secuenciación de nueva generación:

Cebadores

Los adaptadores también sirven como puntos universales de acoplamiento de cebadores. No es posible diseñar individualmente cebadores que coincidan con una molécula de ADN específica para poder amplificar todo el genoma. Los adaptadores proporcionan una caperuza para todas las diferentes cadenas de ADN, de modo que solo tenemos que utilizar dos conjuntos de cebadores para amplificar todas las diferentes moléculas pequeñas de ADN.

Acopladores de la célula de flujo

Los adaptadores también ayudan a las moléculas de ADN a acoplarse/adherirse a la célula de flujo. La célula de flujo está cubierta de muchas moléculas cortas de ADN que son complementarias al adaptador.

Cuando las moléculas de ADN se bombean a la célula de flujo, los adaptadores reconocen las moléculas cortas de ADN unidas a la célula de flujo y se unen a ellas. Esto es imprescindible para que se produzca la generación de clústeres.