Análisis de BLAST

BLAST utiliza estadísticas para ordenar la base de datos de secuencias e identificar las mejores coincidencias.

Figura 1: Puntuación de alineación codificada por colores.

La persona que lo utiliza recibe estos resultados:

• Puntuación máxima

• Puntuación final

• Cobertura de consultas

• Parámetro E

• Identidad máxima

El parámetro E representa la cantidad de resultados que esperas encontrar en una base de datos del mismo tamaño. Los parámetros E bajos indican un resultado significativo. La identidad máxima representa el porcentaje de las identidades compartidas entre la consulta y el acierto en una alineación de nucleótido a nucleótido. Las puntuaciones de alineación son valores numéricos que describen la calidad general de una alineación. El porcentaje de la longitud de la consulta que se incluye en los segmentos alineados se denomina cobertura de la consulta.

Figura 2: Resultado de BLAST.