CY3 y CY5

Los tintes fluorescentes Cy3 y Cy5 se unen al ADN. Son sensibles a la luz y hay que almacenarlos y utilizarlos en la oscuridad el máximo tiempo posible. Por lo tanto, los pasos de etiquetado se realizan empleando tubos oscuros para prevenir la pérdida de señal del fotoblanqueo del tinte.

Las moléculas Cy3 y Cy5 interactúan con el ADN mediante un sistema de enlace universal (ULS, por sus siglas en inglés), que utiliza un compuesto de platino especial. El compuesto de platino tiene dos sitios de unión libres. El primer sitio de unión se une a un grupo marcador, que es el compuesto de cianina (Cy3 y Cy5), lo que da lugar a un complejo Cy ULS. El segundo sitio de unión une el complejo a la purina de un ADN o ARN monocatenario, bicatenario, lineal o superenrollado.