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Marcador de ADN

Un «marcador» de ácido nucleico o muestra estándar de peso molecular es una mezcla de fragmentos de ADN o ARN de longitudes conocidas. Se emplea como escala para determinar las longitudes de fragmentos de ácidos nucleicos desconocidos a la hora de llevar a cabo experimentos de electroforesis en gel. El tamaño de los fragmentos se determina aplicando un gel con el marcador en un pocillo, junto con las muestras de longitudes desconocidas. Las bandas que se muestran a partir de los marcadores de ADN tienen longitudes predeterminadas, como «100 pb», «500 pb», etcétera. Si una banda de una muestra desconocida ha recorrido la misma distancia en el gel que la banda de 500 pb, se puede asumir entonces que el fragmento desconocido tiene una longitud cercana o igual a 500.

Ejemplo de marcador de ADN utilizando una muestra de 10 microlitros en gel de agarosa al dos por ciento. El marcador tiene 8 bandas claras sobre fondo negro. El fragmento más grande y pesado se compone de 2 000 pares de bases y aparece en la parte superior del marcador; el fragmento más pequeño, se compone de 50 pares de bases. El número de pares de bases de un fragmento disminuye conforme las bandas se acercan al ánodo.

Una electroforesis en gel suele realizarse con un marcador en uno de los pocillos. Las longitudes de los fragmentos se dan en pares de bases. En esta imagen, la concentración de un fragmento particular en el marcador también se muestra en ng / 10 ul.