Cadena transportadora de electrones
Del fotosistema II, los electrones son transferidos, primero, a una plastoquinona que los transporta por la cadena de transporte de electrones. La energía de los electrones se utiliza para bombear protones de forma activa al lumen tilacoidal. Los electrones de baja energía son transferidos entonces al fotosistema I, que utiliza la energía luminosa para reenergizar los electrones y reducir NADP+ a NADPH.
Cada transportador de electrones de la cadena de transporte de electrones es a la vez aceptor y dador de electrones. La plastoquinona, por ejemplo, es reducida por el centro de reacción, puesto que tiene un potencial de reducción más alto que el dador de electrones anterior del centro de reacción. El siguiente complejo, la bomba de protones que es el citocromo, vuelve a tener un potencial de reducción más alto. Esto hace que los electrones se muevan por la cadena de transporte de electrones y la energía de los electrones se utiliza para bombear protones al lumen tilacoidal.
Esta es la ecuación química de la reacción luminosa:
2 H2O + 2 NADP+ + nADP + nPi → O2 + 2 NADPH + 2 H+ + nATP