Análisis de la electroforesis en gel
Tras la electroforesis, los diferentes fragmentos se visualizan en forma de bandas a distancias específicas de la parte superior del gel (el extremo del electrodo negativo), según su tamaño. El tamaño de las muestras de ácido nucleico se puede estimar comparando la distancia que han recorrido con la de las muestras estándar de peso molecular (también llamadas marcadores de ADN).
Cada fragmento se muestra como una banda diferente en el gel. Una mezcla de fragmentos de distintos tamaños tiene el aspecto de una mancha larga. Si los fragmentos son demasiado grandes, por ejemplo, ADN genómico sin cortar, formarán una sola banda larga en la parte superior del gel.
Figura 1: Experimento de electroforesis en gel completo, con cinco muestras y el marcador de ADN a la derecha. El marcador de ADN se puede utilizar para estimar los tamaños de las bandas de las muestras.
Los plásmidos circulares se mueven a diferentes velocidades dependiendo de su constitución (abollada, lineal, unida por enlaces covalentes, superenrollada o monocatenaria circular). Un plásmido superenrollado viaja más deprisa porque produce menos fricción con la matriz de agarosa que uno abollado o lineal.
Si quieres aislar un fragmento específico, puedes cortar el gel y extraer el ADN.