Procedimiento de la electroforesis en gel
En la electroforesis en gel, se coloca un electrodo positivo en un extremo de la capa de gel y un ánodo negativo en el otro. La capa de gel está formada por pequeños pocillos en un extremo, donde se cargan los fragmentos de ADN y la mezcla de reactivo (paso 1, figura 1).
El ADN tiene carga negativa. Cuando la corriente pasa por el gel, el ADN se mueve por los poros del gel hacia el electrodo positivo (paso 2, figura 1). Las moléculas de ADN más pequeñas se mueven más deprisa por el gel que aquellas que son más grandes, lo que hace que se separen por tamaño. Los fragmentos se separan por tamaño (paso 3, figura 1) debido a sus diferentes velocidades de movimiento.
Tras la electroforesis, el ADN se visualiza como «bandas» de fragmentos de ADN agrupados según su longitud. Con este método, solo se puede visualizar el ADN en grandes cantidades (millones de copias) (paso 4, figura 1).
Los tamaños de las muestras de ADN pueden estimarse comparando la distancia que recorren con el marcador de ADN («marcador de ADN», en la figura 1).
Figura 1: Fragmentos de diferentes tamaños de una reacción de PCR en un gel. Los fragmentos se moverán a una velocidad y una distancia correspondientes a su tamaño: las moléculas de ADN más pequeñas se moverán más rápido por el gel y llegarán más lejos que las moléculas de ADN de mayor tamaño.