Identificación molecular
Los métodos clásicos de identificación de microbios son relativamente laboriosos y tienden a depender de la capacidad de cultivo de bacterias en el laboratorio. La identificación, empleando métodos moleculares, ha mejorado notablemente la velocidad y la especificidad del proceso de identificación. En este método, las secuencias de ácidos nucleicos (DNA y RNA) de especies conocidas y desconocidas (a partir de una base de datos) son comparadas para determinar sus similitudes. Hay dos tipos principales de identificación molecular:
Métodos genotípicos
Estos métodos implican la extracción de ADN genómico de una especie microbiana desconocida, sometida a más análisis mediante Southern blot, reacción en cadena de la polimerasa (PCR), o polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP).
Métodos basados en proteínas
Estos métodos incluyen el Western blot, la immunoprecipitación y el ensayo por inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA), los cuales emplean anticuerpos para detectar proteínas específicas que son únicas en un organismo.