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Electroforesis en gel de proteínas

La electroforesis en gel de proteínas es una técnica para separar proteínas por tamaño. Durante la preparación de las muestras, se desnaturalizan las proteínas y se les aplica una carga negativa por medio del SDS. La desnaturalización elimina el plegamiento y convierte todas las proteínas en moléculas lineales. La carga negativa HACE que la proteína migre del polo negativo (cátodo) de la parte superior del gel hacia el polo positivo (ánodo) de la parte inferior. El gel funciona como un tamiz molecular. Las proteínas pequeñas migran más fácilmente a través de él que las más grandes. Por tanto, las proteínas pequeñas cubren una gran distancia durante el tiempo de ejecución del experimento y podremos encontrarlas en la parte inferior del gel.

Resultados de la electroforesis en gel presentados como bandas rosas diseminadas por el gel. La columna de la derecha tiene 6 bandas entre la parte superior del gel y la inferior. Está identificada como el marcador. El resto de las columnas, que tienen unas cuantas bandas cada una, representan las muestras. Las bandas rosas están marcadas como fragmentos de proteínas separadas. Podemos comparar sus posiciones dentro del gel con las del marcador para determinar su tamaño.

Figura 1: Experimento de electroforesis en gel completo con 5 muestras y el marcador de proteínas a la derecha. El marcador de proteínas puede utilizarse para estimar los tamaños de las bandas de las muestras.

Tras la electroforesis, las distintas proteínas de la muestra aparecerán como bandas a distancias específicas de la parte superior del gel en función de su tamaño. El tamaño de las bandas de proteínas puede calcularse comparando esa distancia con la de las muestras estándar de peso molecular (también llamadas «marcador»).