Integridad del ARN
Hay varias maneras de evaluar la calidad (también llamada integridad) del ARN aislado.
Un método rápido y barato es la electroforesis: se introduce la muestra de ARN en un gel de agarosa y se observan las bandas resultantes de ARN ribosomal (ARNr). Si las bandas son claras y brillantes, y tienen el tamaño esperado en comparación con el marcador de ADN, el ARN es de buena calidad. Si estas bandas no aparecen y además se aprecian manchas, significa que la muestra de ARN se ha degradado.
Ejemplo de un gel de agarosa de ARN.
Otro método más sofisticado de evaluar la cualidad del ARN es usar el análisis de microfluidos, en el que se ponen pequeñas cantidades de ARN en un aparato para obtener el índice de calidad del ARN (RQI, RNA Quality Index) o el número de integridad del ARN (RIN, RNA Integrity Number), que está entre 0 y 10 (donde 0 significa «totalmente degradado» y 10, «completamente intacto»). Las muestras con un RIN o RQI superior 7 se consideran lo bastante buenas como para proceder con los análisis.
Equipo de análisis de microfluidos.