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El dodecilsulfato sódico (SDS) en la SDS-PAGE

El dodecilsulfato sódico o SDS tiene un grupo de cabeza polar con carga neta negativa al final de una larga cadena hidrófoba de carbono. Cuando la muestra se calienta, el SDS se une a la proteína y la recubre con esos grupos de cabeza con carga negativa. Este proceso desnaturaliza las proteínas a medida que el SDS rompe los enlaces de hidrógeno e iónicos, así como las interacciones hidrófobas que mantienen la forma de la estructura particular de la proteína. Además, cuando el SDS se une a la proteína, la cubre con los grupos de cabeza con carga negativa, lo cual hace que la proteína quede cargada negativamente.

Ilustración de una proteína antes y después de que actúe sobre ella el dodecilsulfato sódico. A la izquierda está la proteína inalterada con la estructura plegada normal que mantienen los enlaces de hidrógeno, iónicos y disulfúricos, así como las interacciones hidrófobas. A la derecha está la proteína ya afectada, con una estructura ligeramente desplegada en la que todos los enlaces de hidrógeno e iónicos, y las interacciones hidrófobas se han roto. Además, la proteína ha quedado cubierta de cargas negativas.

Figura 1. Efecto del SDS sobre la proteína: La proteína antes y después de la actuación del SDS.