Marcadores STR

Los marcadores STR (repeticiones cortas en tándem) son secuencias polimórficas que se encuentran distribuidas de manera similar en los genomas de los mamíferos.

Las repeticiones del núcleo pueden ser di- (dos bases, por ejemplo, CA), tri- (tres bases, por ejemplo, CAG) o tetranucleótidos (cuatros bases, por ejemplo, ATGC). Estas secuencias del núcleo se repiten un cierto número de veces en el locus STR individual (por ejemplo, CACACACACACA o CA entre paréntesis 6 veces).

Diferentes alelos tienen distinto número de repeticiones en los loci STR individuales. En la población, puede haber múltiples alelos (por ejemplo, cinco alelos diferentes), pero en un individuo (diploide), hay un máximo de dos alelos diferentes (uno en cada cromosoma homólogo).

Los loci STR están flanqueados por secuencias únicas y, por tanto, los loci STR individuales pueden amplificarse mediante PCR; además, se puede estimar el tamaño de los alelos mediante electroforesis en gel. De esta manera, se pueden genotipificar los marcadores individuales.