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Electroforesis en gel de poliacrilamida

La electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE) es una técnica utilizada para analizar las proteínas en función de su tamaño. Es bastante similar a la electroforesis en gel de agarosa que se utiliza para analizar el ADN tras realizar la PCR. No obstante, antes de hacer una electroforesis en gel, nuestras proteínas están plegadas en estructuras 3D complejas. Por ello, primero debemos desnaturalizar la estructura 3D de las proteínas y hacerlas lineales. Podemos hacerlo añadiendo dodecilsulfato sódico (SDS), que es un detergente que desenrolla las proteínas y las hace lineales. El SDS también se necesita para cargar las proteínas negativamente. Por eso, esta técnica suele conocerse como SDS-PAGE.

Cuando las proteínas se vuelven lineales y tienen carga negativa, pueden ponerse en un gel de poliacrilamida y aplicarles una carga eléctrica. Las proteínas de carga negativa se desplazarán por la poliacrilamida porosa hacia el polo positivo que se encuentra al final del gel. Las proteínas más largas se desplazarán más tiempo que las más cortas; de esa forma, podremos separar las proteínas por longitud mediante la electroforesis en gel de poliacrilamida.

En la parte superior de la imagen hay proteínas recubiertas de SDS, representadas como cuerdas negras enredadas de varios tamaños. Más abajo, las proteínas se ponen en un rectángulo azul con un signo de menos arriba y uno de más abajo. El rectángulo se denomina «gel de poliacrilamida con uniones cruzadas con aplicación de campo eléctrico» y la flecha que apunta hacia el siguiente rectángulo que está debajo muestra la dirección de la migración. La última imagen, abajo del todo, muestra el mismo rectángulo con las moléculas grandes arriba, las de tamaño medio en el centro y las pequeñas abajo.

Figura 1: Electroforesis en gel de poliacrilamida.