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La ligation de l'adaptateur

Comme expliqué dans la section réparation de l'ADN, l'ajout d'adénine à l'extrémité du brin d'ADN a pour but l'appariement spécifique à la queue thymine de l'adaptateur.

En haut, deux lignes horizontales grises représentent l'ADN à extrémités franches. L'extrémité gauche de la première ligne est appelée 5' et l'extrémité droite 3'. Sur la deuxième ligne, les extrémités sont inversées : 3' est à gauche et 5' à droite. En dessous, une flèche bleue illustre l'ajout de l'adénine à l'extrémité 3' de l'ADN à extrémités franches. L'adénine est marquée sur les deux lignes grises par un A vert. Un autre ensemble de lignes horizontales illustrant la queue thymine de l'adaptateur sont colorées en bleu et en jaune et sont marquées d'un T. Une flèche bleue illustre comment la queue adénine de l'échantillon d'ADN s'apparie spécifiquement à la queue thymine de l'adaptateur.

L'adaptateur est un fragment court complémentaire d'ADN double brin. Un brin possède une queue en T à l'extrémité 3', et l'autre brin est complémentaire du premier.

Étant donné que l'adénine s'apparie spécifiquement avec la thymine, nous pouvons être sûrs qu'une extrémité de l'échantillon d'ADN aura l'adaptateur bleu, tandis que l'autre extrémité aura l'adaptateur orange.

Les fonctions des adaptateurs

Les adaptateurs ont des fonctions importantes dans le séquençage de nouvelle génération.

Les amorces

Les adaptateurs servent également de sites d'accueil universels pour les amorces. Il est impossible de concevoir individuellement des amorces qui correspondent à une molécule d'ADN spécifique pour pouvoir amplifier l'ensemble de notre génome ! Les adaptateurs fournissent une coiffe pour tous les différents brins d'ADN, de sorte qu'il suffit d'utiliser deux jeux d'amorces pour amplifier toutes les différentes petites molécules d'ADN.

Le docker de la cellule d'écoulement

Les adaptateurs aident également ces molécules d'ADN à s'amarrer / se fixer à la cellule d'écoulement qui est recouverte de molécules d'ADN courtes complémentaires de l'adaptateur.

Lorsque les molécules d'ADN sont envoyées dans la cellule d'écoulement, les adaptateurs reconnaissent les molécules d'ADN courtes fixées à la cellule d'écoulement et se lient ensemble. Ceci est important pour la génération d'amas.