L'analyse BLAST
La méthode BLAST utilise des statistiques pour trier la base de données des séquences et identifier ainsi les meilleures correspondances.
Figure 1 : score d'alignement avec code couleur.
L'utilisateur reçoit le résultat suivant :
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le score maximum
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le score total
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la couverture de la requête
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la "E-value" (l'espérance mathématique)
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l'identité maximale
La E-value ou l'espérance mathématique représente le nombre de résultats que vous vous attendez à trouver dans une base de données de même taille. Une E-value faible indique un résultat significatif. L'identité maximale représente le pourcentage d'identités partagées entre la requête et le résultat dans un alignement nucléotide à nucléotide. Les scores d'alignement sont des valeurs numériques qui décrivent la qualité globale d'un alignement. Le pourcentage de la longueur de la requête qui est incluse dans les segments alignés est appelé la couverture de la requête.
Figure 2 : résultat du Blast.