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Les standards de masse moléculaire

Une « étalon » d'acide nucléique, ou un échantillon standard de poids moléculaire, est un mélange de fragments d'ADN ou d'ARN de longueurs connues. Elle est utilisée comme échelle pour déterminer les longueurs des fragments d'acide nucléique inconnus lors de la réalisation d'expériences d'électrophorèse sur gel. La taille des fragments est déterminée en utilisant un gel contenant l'échelle dans un puits à côté des échantillons de longueurs inconnues. Les bandes qui apparaissent sur l’échelle d’ADN ont des longueurs prédéterminées comme "100 pb, "500 pb", etc. Si une bande d’un échantillon inconnu a parcouru la même distance dans le gel qu’une bande de 500 pb, on peut partir du principe que le fragment inconnu a une longueur égale ou quasi égale à 500 pb.

Un exemple d'échelle d'ADN, utilisant un échantillon de 10 microlitres sur un gel d'agarose à deux pour cent. L'échelle apparaît comme 8 bandes claires sur un fond noir. Le fragment le plus grand et le plus lourd est constitué de 2000 paires de bases et apparaît au sommet de l'échelle, le plus petit fragment est constitué de 50 paires de bases. Le nombre de paires de bases dans un fragment diminue à mesure que les bandes se déplacent vers l'anode.

En général, on réalise une électrophorèse sur gel avec une échelle d’ADN dans un des puits. Les longueurs des fragments sont données en paires de bases. Sur cette image, la concentration du fragment spécifique dans l’échelle est affichée en ng/10uL.