La préparation de la fermentation

L'inoculum

Pour démarrer une fermentation, il faut une préculture avec un certain nombre de cellules saines en guise d'inoculum. Une culture utilisée pour l'inoculation (inoculum) d'une fermentation doit répondre aux critères suivants :

• Être saine et active pour réduire au maximum la phase de latence

• Ne présenter aucune trace de contamination

• Posséder une forme morphologique adaptée

• Être disponible en volume suffisant

• Conserver ses capacités de formation de produit

Éviter toute contamination

L'une des pires choses qui puisse arriver lors d'une expérience de fermentation est la détection de contaminants. Les contaminants sont des microorganismes indésirables qui disputent les nutriments à la souche originale et perturbent l'expérience. Les contaminants peuvent être détectés au microscope ou à partir de l'ensemble des données. En général, les contaminants se développent rapidement. Cela entraîne une augmentation des niveaux de CO₂ et de la concentration de biomasse par rapport au produit. Il est primordial d'éviter toute contamination ; le bioréacteur doit donc être stérilisé avant le début de la fermentation.

Les fermenteurs ou bioréacteurs peuvent être stérilisés avec ou sans le milieu. Normalement, on les stérilise en chauffant l'enveloppe ou la bobine du bioréacteur avec la vapeur dans la cuve. Pour la stérilisation, la pression de vapeur à l'intérieur de la cuve correspond à 1 bar et est maintenue pendant 20 minutes. Une fois la stérilisation terminée, il est important de maintenir une pression positive à l'intérieur de la cuve. Sinon, un vide peut se former et de l'air non stérile peut être aspiré dans la cuve.