La préparation de l'électrophorèse sur gel
Pour réaliser une expérience d'électrophorèse sur gel, vous avez besoin des éléments suivants :
- Une matrice de gel semi-solide et poreuse
- Un échantillon d'ADN ou d'ARN
- Un tampon de chargement
- Du colorant
- Des échantillons-types de poids moléculaire ou "marqueurs"
Une matrice de gel poreux semi-solide : il s'agit généralement d'un gel d'agarose ou de polyacrylamide. Dans le laboratoire virtuel, ce gel a été préparé au préalable dans la machine d'électrophorèse sur gel.
Un échantillon d'ADN ou d'ARN : il vous faudra une quantité suffisante d'ADN ou d'ARN qui a été isolé et traité pour que l'échantillon soit visible dans une expérience d'électrophorèse sur gel.
Un tampon de chargement : le tampon de chargement contient un réactif coloré qui aide à visualiser la distance parcourue par l'ADN ou l'ARN pendant l'électrophorèse sur gel. En outre, le tampon de chargement alourdit l'échantillon afin qu'il puisse couler au fond du gel.
Il contient généralement les produits chimiques suivants :
- un réactif de coloration, comme par exemple le xylène, le rouge de crésol, le bleu de bromophénol ou l'orange G.
- un réactif à haute viscosité, comme par exemple le ficoll, la saccharose ou le glycérol pour rendre l'échantillon plus visqueux et plus lourd.
- de l'eau pour diluer les réactifs susmentionnés.
Du colorant : des colorants fluorescents ou colorés qui se lient aux acides nucléiques sont ajoutés au mélange de gel pendant la préparation. Alternativement, le gel peut être trempé dans une solution de colorant une fois l'électrophorèse terminée.
Des échantillons-types de poids moléculaire : ils sont analysés en même temps que l'échantillon d'ADN ou d'ARN pour fournir une référence de taille. Ils sont également connus sous le nom de "marqueurs".