Les principes de la génétique
Les expériences d'hybridation de Mendel démontrent la différence entre phénotype et génotype. Lors d'une fécondation croisée de plantes de lignée pure (P1), l'une aux gousses jaunes et l'autre aux gousses vertes, tous les descendants hybrides de première génération (F1) avaient des gousses jaunes. En d'autres termes, ils étaient phénotypiquement identiques au parent aux gousses jaunes. Cependant, nous savons que l'allèle donné par le parent aux gousses vertes n'a pas été perdu car il est réapparu chez quelques descendants de deuxième génération (F2). Par conséquent, les plantes F1 étaient génotypiquement différentes du parent aux gousses jaunes.
Les plantes P1 que Mendel a utilisées dans ses expériences étaient toutes homozygotes pour le caractère étudié. Les organismes diploïdes qui sont homozygotes pour un gène donné, ou locus, possèdent deux allèles identiques pour ce gène sur leurs chromosomes homologues. Les plants de pois parentaux de Mendel se reproduisaient toujours à l'identique parce que les deux gamètes portaient le même caractère. Lorsque des plantes P1 présentant des caractères contrastés étaient fécondées par croisement, tous leurs descendants étaient hétérozygotes pour le caractère contrasté, ce qui signifie que leur génotype exprimait des allèles différents pour le gène examiné.