Pénétrance incomplète des allèles

Tous les allèles n'ont pas une pénétrance complète, comme le montre l'exemple ci-dessus. Certains allèles ont une pénétrance incomplète, ce qui signifie que même si l'individu possède un certain génotype, il ne présente pas le phénotype. Par exemple, si l'allèle A a une pénétrance incomplète, la plupart des personnes ayant le génotype AA ont les cheveux foncés, mais certaines personnes ayant exactement le même génotype que AA ont les cheveux plus clairs.