L'équation de Michaelis-Menten
Le modèle de Michaelis-Menten est un simple modèle de réaction enzymatique développé par Leonor Michaelis et Maud Menten en 1913. Il se fonde sur les deux hypothèses suivantes :
- Une réaction enzymatique se déroule en 2 étapes : formation d’un complexe enzyme-substrat, ES, et dissociation de l’enzyme et du produit.
- Après une (très) courte période de temps, la concentration du complexe ES atteint l’état d’équilibre, où la vitesse de formation de l’ES est égale à la vitesse à laquelle il est utilisé.
La première hypothèse implique que la réaction enzymatique est constituée de 4 réactions différentes : formation de l’ES à partir de E et S, dissociation de l’ES en E et S, dissociation de l’ES en E et P, et formation de l’ES à partir de E et P. La vitesse d’une réaction est généralement mesurée au début de la réaction, lorsque aucune quantité significative de P n’a été formée ; par conséquent, la vitesse de formation de l’ES à partir de E et P peut être ignorée. On obtient ainsi la réaction totale suivante (figure 1.a) [1].
Figure 1 : Figure 1.a : La réaction enzymatique dans son ensemble ; Figure 1.b : La représentation graphique des vitesses initiales d’une réaction enzymatique en fonction de la concentration du substrat et une courbe de Michaelis-Menten associée à cette représentation. Lorsque la concentration du substrat est faible, la courbe est raide ; cependant, à des concentrations plus élevées, la courbe atteint un seuil et la vitesse se rapproche de Vmax. La figure indique également clairement l’interprétation de km ; km est égal à la concentration du substrat pour laquelle la vitesse de réaction est ½ • Vmax. [1]
Cette réaction implique que la vitesse de formation des produits, c’est-à-dire la vitesse de réaction, est déterminée par la formule V = k2 • [ES]. Lorsque la quasi-totalité de l’enzyme est intégrée au complexe enzyme-substrat, la réaction tend vers sa vitesse maximale (Vmax). Dans la réaction ci-dessus, k2 est l’étape qui limite la vitesse, et Vmax peut donc être représentée sous la forme [E] • k2. La constante de la limitation de vitesse est également appelée kcat, ou le nombre de rotations, et dans la réaction ci-dessus, kcat = k2. Cela signifie que Vmax = kcat - [E]• [1]
Les références
- Lehninger, Albert L. ; Nelson, David L. ; Cox, Michael M. (2008). Principles of Biochemistry (5th ed.). New York, NY : W.H. Freeman and Company. ISBN 978-0-7167-7108-1.