L'identification moléculaire

Les méthodes classiques d'identification des microbes sont relativement laborieuses et ont tendance à reposer sur la capacité à cultiver des bactéries en laboratoire. L'identification par des méthodes moléculaires a considérablement amélioré la rapidité et la spécificité du processus d'identification. Dans cette méthode, les séquences d'acides nucléiques (ADN et ARN) d'espèces inconnues et d'espèces connues (provenant d'une base de données) sont comparées pour déterminer leurs similitudes. Il existe deux principaux types d'identification moléculaire :

Les méthodes génotypiques

Ces méthodes impliquent l'extraction de l'ADN génomique d'une espèce de microbe inconnue, qui est ensuite analysé par transfert de Southern, réaction de polymérisation en chaîne (PCR) ou polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP).

Les méthodes basées sur les protéines

Ces méthodes comprennent le transfert de Western, l'immunoprécipitation et le test ELISA (essai d'immuno-absorption enzymatique), qui utilisent des anticorps pour détecter des protéines spécifiques propres à un organisme.