L'intégrité de l'ARN

Il existe plusieurs méthodes pour évaluer la qualité (également appelée intégrité) de l'ARN isolé.

Une méthode rapide et économique est l'électrophorèse qui consiste à appliquer l'échantillon d'ARN sur un gel d'agarose puis à examiner les bandes d'ARN ribosomique (ARNr) obtenues. Si les bandes sont claires et ont la taille prévue selon l'échelle d'ADN, l'ARN est de bonne qualité. L'absence de ces bandes conjugué à la présence de traces indiquent un échantillon d'ARN dégradé.

Exemple d'un gel d'agarose ARN

Il existe un autre moyen, plus perfectionné, d'évaluer la qualité des ARN : l'analyse microfluidique. Celle-ci consiste à charger des quantités infimes d'ARN sur une puce pour obtenir un indice de qualité de l'ARN (RQI) ou numéro d'intégrité de l'ARN (RIN), dont la valeur est comprise entre 0 et 10 (0 pour totalement dégradé et 10 pour absolument intact). Les échantillons dont le RIN ou le RQI est supérieur à 7 sont considérés comme acceptables pour une analyse ultérieure.

Équipement d'analyse microfluidique.