Le séquençage de l'ARN (RNA-seq)

Le développement récent du séquençage de nouvelle génération nous permet de séquencer le transcriptome dans un tissu donné à un moment précis du développement. RNA-seq révèle un instantané des ARN présents et nous permet de les quantifier pour déterminer le niveau d'expression génique.

L'instabilité des molécules d'ARN rend indispensable la transcription inverse des transcrits en ADN pour le séquençage.

Le séquençage de l'ARNm fait intervenir les étapes suivantes :

1. L'isolement de l'ARN

2. La purification de l'ARNm

3. La transcription inverse de l'ARN en ADNc

4. Les modifications de l'ADN pour le NGS

5. La génération d'amas pour le NGS

6. Le NGS