Les marqueurs STR

Les marqueurs STR (Short Tandem Repeat) ou microsatellites sont des séquences polymorphes positionnées à intervalles réguliers dans les génomes des mammifères.

Les répétitions du noyau peuvent être des di- (deux bases, par exemple CA), tri- (trois bases, par exemple CAG) ou tétra-nucléotides (quatre bases, par exemple ATGC). Ces séquences centrales sont répétées un certain nombre de fois les unes après les autres (par exemple, CACACACACACA ou CA entre parenthèses fois 6).

Les différents allèles ont un nombre différent de répétitions dans les loci STR individuels. Dans la population, plusieurs allèles peuvent être présents (par exemple, cinq allèles différents), mais chez un individu (diploïde), il y a au maximum deux allèles différents (un sur chaque chromosome homologue).

Les loci STR étant flanqués de séquences uniques, les loci STR individuels peuvent être amplifiés par PCR et les tailles des allèles estimées par électrophorèse sur gel. De cette manière, on peut effectuer le génotypage des marqueurs individuels.