L'électrophorèse sur gel
L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide (PAGE) est une technique utilisée pour analyser les protéines en fonction de leur taille. Elle est assez similaire à l'électrophorèse sur gel d'agarose qui est utilisée pour analyser l'ADN après avoir effectué la PCR. Cependant, avant d'effectuer une électrophorèse sur gel, les protéines sont repliées en structures 3D complexes. Par conséquent, nous devons d'abord dénaturer la structure 3D des protéines et les rendre linéaires. Nous pouvons le faire en ajoutant du dodécylsulfate de sodium (SDS) qui est un détergent qui défait les protéines pour les rendre linéaires. Le SDS est également nécessaire pour charger négativement les protéines. C'est pourquoi cette technique est communément appelée SDS-PAGE.
Lorsque les protéines sont linéarisées et ont une charge négative, nous pouvons les charger sur un gel de polyacrylamide et appliquer une charge électrique. Les protéines chargées négativement traverseront le polyacrylamide poreux en direction du pôle positif qui se trouve à l'extrémité du gel. Étant donné que les protéines longues se déplacent plus lentement que les courtes, nous pouvons séparer les protéines en fonction de leur longueur par électrophorèse sur gel de polyacrylamide.
Figure 1 : électrophorèse sur gel de polyacrylamide.