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L'électrophorèse sur gel

L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide (PAGE) est une technique utilisée pour analyser les protéines en fonction de leur taille. Elle est assez similaire à l'électrophorèse sur gel d'agarose qui est utilisée pour analyser l'ADN après avoir effectué la PCR. Cependant, avant d'effectuer une électrophorèse sur gel, les protéines sont repliées en structures 3D complexes. Par conséquent, nous devons d'abord dénaturer la structure 3D des protéines et les rendre linéaires. Nous pouvons le faire en ajoutant du dodécylsulfate de sodium (SDS) qui est un détergent qui défait les protéines pour les rendre linéaires. Le SDS est également nécessaire pour charger négativement les protéines. C'est pourquoi cette technique est communément appelée SDS-PAGE.

Lorsque les protéines sont linéarisées et ont une charge négative, nous pouvons les charger sur un gel de polyacrylamide et appliquer une charge électrique. Les protéines chargées négativement traverseront le polyacrylamide poreux en direction du pôle positif qui se trouve à l'extrémité du gel. Étant donné que les protéines longues se déplacent plus lentement que les courtes, nous pouvons séparer les protéines en fonction de leur longueur par électrophorèse sur gel de polyacrylamide.

En haut de l'image se trouvent des protéines enrobées de SDS représentées par des cordes noires enchevêtrées de différentes tailles. En dessous, les protéines sont placées dans un rectangle bleu avec le signe moins en haut et le signe plus en bas. Le rectangle est appellé "gel de polyacrylamide réticulé avec application d'un champ électrique" et la flèche pointant vers le bas à côté du rectangle indique la direction de la migration. La dernière image en bas montre le même rectangle avec les molécules de grande taille en haut, de taille moyenne au milieu et de petite taille en bas.

Figure 1 : électrophorèse sur gel de polyacrylamide.