Ligazione degli adattatori

Come spiegato nella sezione riparazione delle estremità, lo scopo di aggiungere adenina alla fine del filamento di DNA è quello di permettere l'accoppiamento specifico con la coda di timina dell'adattatore.

L'adattatore è un breve pezzo complementare di DNA a doppio filamento. Un filamento ha una coda a T all'estremità 3', e l'altro filamento è complementare al primo filamento.

Poiché l'adenina si accoppia specificamente con la timina, possiamo essere sicuri che un'estremità del campione di DNA avrà l'adattatore blu, mentre l'altra estremità avrà l'adattatore arancione.

Funzioni degli adattatori

Gli adattatori hanno funzioni importanti nella Next Generation Sequencing.

Primer

Gli adattatori servono anche come siti universali di aggancio dei primer. Non è possibile progettare individualmente primer che corrispondano ad una specifica molecola di DNA in modo da amplificare tutto il nostro genoma. Gli adattatori forniscono una chiusura per tutti i diversi filamenti di DNA in modo che sia necessario usare solo due set di primer per amplificare tutte le diverse piccole molecole di DNA.

Aggancio alla cella di flusso

Gli adattatori aiutano anche tali molecole di DNA ad agganciarsi/legarsi alla cella di flusso che è coperta da molte brevi molecole di DNA complementari all'adattatore.

Quando le molecole di DNA vengono pompate nella cella di flusso, gli adattatori riconoscono le brevi molecole di DNA e si legano insieme. Questo è importante affinché avvenga la generazione di cluster.