Analisi BLAST

BLAST utilizza le statistiche per ordinare il database delle sequenze e quindi identificare le migliori corrispondenze.

Figura 1: Punteggio di allineamento codificato a colori

L'utente riceve il seguente output:

• Punteggio massimo

• Punteggio totale

• Copertura della query

• Valore E

• Identità massima

Il valore E o valore atteso rappresenta il numero di corrispondenze positive che ci si aspetta di trovare in un database della stessa dimensione. Bassi valori E indicano un risultato significativo. L'identità massima rappresenta la percentuale di identità condivise tra la query e la risposta positiva in un allineamento nucleotide-nucleotide. I punteggi di allineamento sono valori numerici che descrivono la qualità complessiva di un allineamento. La percentuale della lunghezza della query che è inclusa nei segmenti allineati è chiamata copertura della query.

Figura 2: Risultato BLAST.