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Scala di DNA

Una "scala" di acido nucleico o campione di peso molecolare standard è una miscela di frammenti di DNA o RNA di lunghezza nota. Viene usata come scala per determinare le lunghezze dei frammenti di acidi nucleici sconosciuti quando si eseguono esperimenti di elettroforesi su gel. Le dimensioni dei frammenti vengono determinate facendo correre un gel con la scala in un pozzetto accanto ai campioni di lunghezza sconosciuta. Le bande che appaiono dalla scala del DNA hanno lunghezze predeterminate come "100 bp", "500 bp" e altre. Se una banda del campione sconosciuto ha percorso la stessa distanza sul gel della banda da 500 bp, si può presumere che il frammento sconosciuto abbia una lunghezza simile o uguale a 500.

Un esempio di scala di DNA, utilizzando un campione di 10 microlitri su un gel di agarosio al due per cento. La scala ha l'aspetto di 8 bande chiare su uno sfondo nero. Il frammento più grande e pesante è costituito da 2000 coppie di basi e appare in cima alla scala, mentre il frammento più piccolo consiste di 50 coppie di basi. Il numero di coppie di basi in un frammento diminuisce man mano che le bande si spostano verso l'anodo.

Un'elettroforesi su gel viene solitamente eseguita con una "scala" in uno dei pozzetti. Le lunghezze dei frammenti sono date in coppie di basi. In questa immagine anche la concentrazione del particolare frammento nella “scala" è visualizzata in ng/10uL.