Catena di trasporto degli elettroni
Dal fotosistema II, gli elettroni vengono trasferiti al plastochinone che immette gli elettroni nella relativa catena di trasporto. L'energia degli elettroni viene utilizzata per spingere i protoni nel lume del tilacoide. La bassa energia degli elettroni viene poi trasferita al fotosistema I che utilizza l'energia solare per energizzare nuovamente gli elettroni e ridurre il NADP+ in NADPH.
Ogni trasportatore presente nella catena di trasporto è sia accettore che donatore di elettroni. Il plastochinone, ad esempio, viene ridotto dal centro di reazione perché ha un potenziale di riduzione maggiore del precedente elettrone donatore nel centro di reazione. Il successivo complesso, la pompa protonica del citocromo, possiede di nuovo un maggiore potenziale di riduzione. Questo comporta il movimento degli elettroni lungo la catena di trasporto e l'energia degli elettroni viene utilizzata per spingere gli elettroni nel lume del tilacoide.
L'equazione chimica della fase luminosa è la seguente:
2 H2O + 2 NADP+ + nADP + nPi → O2 + 2 NADPH + 2 H+ + nATP