Riparazione delle estremità

Generalmente il DNA frammentato (sia frammentato artificialmente che parzialmente degradato) ha estremità coesive, il che implica che un filamento è più lungo dell'altro (vedi Figura 1).

Figura 1. Confronto fra estremità tronche del DNA con entrambi i filamenti della stessa lunghezza ed estremità coesive del DNA con un filamento più lungo dell'altro.

Il DNA con estremità coesive si lega facilmente ad altro DNA che ha estremità coesive complementari. Per impedire che il DNA con queste estremità coesive si accoppi con altro DNA, abbiamo bisogno di modificarle in estremità tronche (vedi Figura 1). Uno dei passaggi nella preparazione del campione NGS consiste nel riparare queste estremità coesive e creare DNA con estremità tronche. Questo è importante per il passo successivo, l'estremità sporgente di A.

Vedi anche: enzimi di riparazione delle estremità.