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Enzimi di riparazione delle estremità

Per riparare il DNA con estremità coesive vengono solitamente utilizzati due enzimi (vedi Figura 1):

  • Polimerasi: la polimerasi riempie le basi mancanti per il filamento, nella direzione da 5' a 3'. Il DNA a doppio filamento risultante avrà la stessa lunghezza del filamento di DNA iniziale più lungo.
  • Esonucleasi: l'esonucleasi rimuove l'estremità sporgente 3'. Il DNA a doppio filamento risultante sarà della stessa lunghezza del filamento di DNA iniziale più corto.

Due reazioni che mostrano come la polimerasi e l'esonucleasi riparano le estremità coesive del DNA. La prima reazione inizia con il 5' fino al 3' contenente il nucleotide G e il 3' fino al 5' contenente i nucleotidi C, T, T, A, A. Questo significa che c'è un'estremità sporgente 5' e dopo la scissione di E c o R 1 si è formata un'estremità coesiva. Sopra la freccia di reazione è indicato d N T P s, e sotto l'attività della polimerasi da 5' a 3'. Alla fine della reazione, l'estremità coesiva viene riempita per produrre un frammento tronco. Il 5' fino al 3' contiene i nucleotidi G, A, A, T, T, T, e il 3' fino al 5' contiene i nucleotidi C, T, T, A, A. La seconda reazione inizia con il 5' fino al 3' contenente i nucleotidi G, G, T, A, C, e un 3' fino al 5' contenente il nucleotide C. Questo significa che c'è un'estremità sporgente di 3' e dopo la scissione K p n 1 si è formata un'estremità coesiva. Sopra la freccia di reazione è indicato d N T P s, e sotto c'è l'attività dell'esonucleasi da 3' a 5' della polimerasi. Alla fine della reazione, l'estremità coesiva viene rimossa per produrre un frammento tronco. Il 5'-3' contiene il nucleotide G e il 3'-5' il nucleotide C.

Figura 1. La polimerasi aggiunge nucleotidi in direzione 5' → 3' e l'esonucleasi rimuove i nucleotidi dall'estremità sporgente 3'.

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Riparazione delle estremità