Analisi dell'elettroforesi su gel
Dopo l'elettroforesi, i diversi frammenti sono visualizzati come bande a distanze specifiche dalla parte superiore del gel (l'estremità negativa dell'elettrodo) in base alle loro dimensioni. Le dimensioni dei campioni di acido nucleico possono essere stimate confrontando la distanza con i campioni di peso molecolare standard (chiamati anche scala di DNA).
Ogni frammento sarà una banda nel gel. Una miscela di frammenti di varie dimensioni appare come una lunga striscia. Se i frammenti sono troppo grandi, come nel caso del DNA genomico non tagliato, formeranno una singola grande banda nella parte superiore del gel.
Figura 1: un esperimento di elettroforesi su gel completato con 5 campioni e la scala di DNA sulla destra. La scala di DNA può essere utilizzata per stimare le dimensioni delle bande nei campioni.
I plasmidi circolari si muovono a velocità diverse a seconda della loro conformazione (intaccata, lineare, legata in modo covalente, superavvolta e circolare a singolo filamento). Un plasmide superavvolto viaggia più velocemente perché ha meno attrito contro la matrice di agarosio rispetto al plasmide intaccato o lineare.
Se vuoi isolare un frammento specifico puoi tagliare il gel ed estrarre il DNA.