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L'elettroforesi su gel delle proteine

L'elettroforesi su gel delle proteine è una tecnica usata per separare le proteine in base alle loro dimensioni. Nella preparazione del campione, le proteine vengono denaturate e caricate negativamente tramite l'SDS. La denaturazione rimuove il ripiegamento e trasforma tutte le proteine in molecole lineari. La carica negativa significa che le proteine migrano dal polo negativo (catodo) nella parte superiore del gel verso il polo positivo (anodo) nella parte inferiore. Il gel funziona come un setaccio che filtra le molecole: le proteine piccole migrano più facilmente attraverso di esso rispetto alle proteine grandi. Pertanto, le proteine piccole coprono una distanza maggiore durante il tempo di esecuzione dell'esperimento e si troveranno verso il fondo del gel.

I risultati dell'elettroforesi su gel si presentano come bande rosa sparse in tutto il gel. La prima colonna a destra con 6 bande che si estendono dall'alto verso il basso del gel è denominata marcatore, noto anche come scala. Il resto delle colonne con poche bande in ogni colonna rappresentano i campioni. Le bande rosa sono contrassegnate come frammenti di proteine separate e la loro posizione nel gel può essere confrontata con la scala per determinare la loro dimensione.

Figura 1: Un esperimento di elettroforesi su gel completato con 5 campioni e la scala di proteine, anche detta marcatore di peso molecolare, sulla destra. La scala di proteine può essere usata per stimare le dimensioni delle bande nei campioni.

Dopo l'elettroforesi, le diverse proteine del campione appariranno come bande a distanze specifiche dalla cima del gel in base alla loro dimensione. Le dimensioni delle bande di proteine possono essere stimate confrontando la distanza con i marcatori standard di peso molecolare (la scala di proteine).