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Analisi RNA-seq

Il recente sviluppo del Next Generation Sequencing ci permette di sequenziare il trascrittoma di un certo tessuto in uno specifico momento dello sviluppo. L'analisi RNA-seq rivela un'istantanea degli RNA presenti e ci permette anche di quantificare gli RNA per determinare i livelli di espressione genica.

L'instabilità delle molecole di RNA rende necessaria la trascrizione inversa in DNA dei trascritti per il sequenziamento.

Per sequenziare l'mRNA dobbiamo eseguire i seguenti passaggi:.

  1. Isolare l'RNA

  2. Purificare l'mRNA

  3. Effettuare la trascrizione inversa dell'RNA in cDNA

  4. Modificare il DNA per il NGS

  5. Generare i cluster per il NGS

  6. Effettuare il NGS