Analisi dei microsatelliti (STR)

Uno dei modi più comuni per ottenere un profilo del DNA consiste nell'eseguire un'analisi dei microsatelliti (STR), ovvero sequenze ripetute di DNA costituite da unità di ripetizione molto corte. Ecco la procedura da seguire:

1) Estrarre e purificare il DNA da un campione.

2) Utilizzare la tecnica PCR per amplificare i microsatelliti. Una serie di primer, posizionati sulle regioni fiancheggianti di una sequenza variabile, amplificherà frammenti di lunghezze diverse a seconda del numero di ripetizioni (vedi immagine sotto). Esiste la possibilità che due individui condividano lo stesso numero di ripetizioni in un determinato sito. Se utilizzassimo un solo set di primer (amplificando esclusivamente una regione ripetuta), il rischio che un individuo abbia lo stesso numero di ripetizioni di un altro sarebbe troppo elevato. Pertanto, durante la profilazione del DNA, viene esaminato un minimo di 13 sequenze di ripetizione.

3) Utilizzare l'elettroforesi su gel per analizzare la lunghezza delle sequenze di ripetizioni e ottenere così il profilo del DNA.