Marcatori STR

I marcatori STR (Short Tandem Repeat) sono sequenze polimorfiche reperibili in tutti i genomi dei mammiferi.

La base delle ripetizioni possono essere di- (due basi, es., CA), tri- (tre basi, es., CAG) o tetra-nucleotidi (quattro basi, es., ATGC). Queste sequenze principali sono ripetute un certo numero di volte una dopo l'altra (es., CACACACACACA o CA moltiplicato per 6 in parentesi).

Alleli diversi hanno numeri di ripetizioni differenti nel loci STR individuali. Nella popolazione, possono essere presenti numerosi alleli (es. cinque alleli differenti), ma in un individuo (diploide), si trovano un massimo di due alleli diversi (uno su ogni cromosoma omologo).

L'STR di loci è fiancheggiato da sequenze uniche, pertanto L'STR di loci di un individuo può essere amplificato grazie alla PCR e la dimensione degli alleli determinata attraverso l'elettroforesi su gel. In questo modo può essere effettuata la genotipizzazione dei marcatori individuali.